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Inicio/Aplicaciones/Diagnóstico in vitro (IVD)/Diagnóstico molecular
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Diagnóstico molecular: integrar recuperación de ácidos nucleicos, preparación de amplificación y control de contaminación en los circuitos

Guía de aplicación

Las estaciones de diagnóstico molecular extraen ácidos nucleicos de las muestras y los incorporan a la reacción de amplificación según el método. Volúmenes de transferencia iguales pueden producir distinta recuperación, residuos de lavado y contaminación entre muestras. La configuración debe responder a tres preguntas: qué se transfiere, adónde y qué queda después del paso.

Este artículo aborda suministro por circuitos fijos, pipeteo con puntas desechables y transferencia mediante varillas magnéticas. Pueden combinarse: bombas y válvulas fijas dispensan reactivos comunes, las varillas transfieren partículas y las puntas transfieren el eluido. La extracción con varillas se basa en transferir partículas; no debe describirse cada paso como aspiración del sobrenadante.[1]

Alcance

Para definir configuraciones de extracción con partículas magnéticas y preparación previa a la amplificación; las acciones, consumibles y aceptación dependen del método y de la arquitectura. Aquí, eluido de ácidos nucleicos significa la solución obtenida en la extracción, mientras que producto de amplificación es el ácido nucleico generado después; deben gestionarse por separado.

Guía de aplicación

Diagnóstico molecular

Diagnóstico molecular
Bombas de diafragma en diagnóstico molecular
Detección de burbujas y presión en diagnóstico molecular
Tubos y racores en diagnóstico molecular
Válvulas rotativas multipuerto en diagnóstico molecular
Aislamiento de circuitos de reactivo, eluido de ácidos nucleicos y residuos
Bombas de pipeteo por desplazamiento de aire en diagnóstico molecular
Lavado con puntas y transferencia del eluido de ácidos nucleicos
Bombas de jeringa en diagnóstico molecular
Dispensación de reactivos de lisis y unión mediante circuitos fijos

En esta página

¿Qué ramales componen los circuitos de diagnóstico molecular?Funciones de los productos habituales y guías de aplicaciónCondiciones de funcionamiento que deben confirmarse en cada etapaLisis y preparación de reactivos: configurar según las formulaciones realesSeparación, lavado y elución: evaluar las acciones mediante la recuperación de ácidos nucleicosCircuitos y aislamiento: definir los recorridos de ácidos nucleicos, reactivos y residuosConexiones: considerar adsorción y recuperación completaMonitorización: relacionar la preparación de amplificación con el estado de la muestraExplore configuraciones mediante las guías de aplicación de productosValide el ciclo completo mediante los resultados de la aplicaciónPreguntas habituales de selección y recuperaciónReferencias

01¿Qué ramales componen los circuitos de diagnóstico molecular?

Preparación de muestras y reactivos→Lisis y unión→Separación y lavado→Elución y transferencia de ácidos nucleicos→Preparación de la reacción de amplificación→Cerrar y transferir a amplificación
Secuencia de tareas de manejo de líquidos

Las flechas indican relaciones entre tareas, no que todos los componentes estén conectados en serie en un solo tubo. Compruebe las posiciones de válvula, el alcance del contacto del líquido con la bomba y los estados de funcionamiento de cada ramal.

Trace primero los circuitos de muestra, reactivos comunes, eluido y residuos; después asigne suministro, pipeteo y manipulación de partículas. Dibuje por separado las estaciones de lavado y los ramales de evacuación e incluya los desvíos de mantenimiento.

¿Qué ramales componen los circuitos de diagnóstico molecular?
ImplementaciónTarea realizadaCriterio de configuración
Suministro por circuito fijoDispensar reactivos desde depósitos o aspirar residuosAdecuado para suministro repetido; comprobar residuos y limpieza entre cambios en tramos compartidos
Pipeteo con puntas desechablesTransferir muestras, eluido de ácidos nucleicos y reactivos de amplificaciónGestionar los circuitos en contacto con el líquido sustituyendo consumibles y validar las operaciones de pequeño volumen
Transferencia con varillas magnéticasLas varillas magnéticas y sus fundas desechables transfieren partículas entre pocillos de reactivosCentrarse en recogida y liberación de partículas y líquido arrastrado con ellas; bombas o puntas pueden preparar líquidos antes y después

02Funciones de los productos habituales y guías de aplicación

Facilite a FOREACH los siguientes límites de tarea para ajustar la configuración. Las categorías indican funciones candidatas; el modelo final requiere líquidos reales, puntos de trabajo y ensayos del equipo. Las bombas HMD seleccionan circuitos mediante electroválvulas y ofrecen uno o varios canales dosificadores; HLD3/HLD6 utilizan válvulas rotativas con una unidad dosificadora. Distinga entre selección de múltiples circuitos y dosificación simultánea multicanal.[4][5]

Funciones de los productos habituales y guías de aplicación
Categoría de productoTarea candidataCondiciones que determinan la configuración
Bomba de jeringaAspiración y dispensación dosificadas de reactivos en circuitos fijosDosis por operación, número de ciclos, reactivo real y materiales en contacto con el líquido
Bomba de pipeteo por desplazamiento de aireTransferir muestras y eluido mediante puntas desechablesDosis mínima real, compatibilidad de puntas, viscosidad y tiempos de aspiración y dispensación
Bombas de diafragma para líquidos / gas y líquidoSuministro de estaciones de lavado o aspiración de residuos con aireDiseñar por separado suministro continuo y dosificación en la estación; confirmar las condiciones gas-líquido
Válvula rotativa multipuertoSeleccionar circuitos fijos de suministro de reactivosVolumen compartido, secuencia de conmutación y coste de limpieza
Detección de burbujas y presión y conexionesSeñales de anomalía y circuito en contacto con el líquido completoUmbrales de señal, materiales, adsorción, volumen muerto y sellado de conexiones
  • Bombas de jeringa en diagnóstico molecular
  • Bombas de pipeteo por desplazamiento de aire en diagnóstico molecular
  • Bombas de diafragma en diagnóstico molecular
  • Válvulas rotativas multipuerto en diagnóstico molecular
  • Detección de burbujas y presión en diagnóstico molecular
  • Tubos y racores en diagnóstico molecular

03Condiciones de funcionamiento que deben confirmarse en cada etapa

Los datos de selección deben describir acciones concretas; indicar «para extracción de ácidos nucleicos» no basta para determinar la idoneidad de una bomba o válvula.

Condiciones de funcionamiento que deben confirmarse en cada etapa
EtapaInformación necesaria
Lisis y uniónFormulación, temperatura, viscosidad y dosis del reactivo; transferencia o no de muestras con partículas o muy viscosas
Lavado y eluciónUbicación de partículas, pipeteo de líquido o transferencia de partículas, arrastre de líquido admisible y destino del eluido
Circuitos de válvulas y conexionesTubos compartidos, volumen de limpieza, estado sin alimentación, interfaces de mantenimiento y todos los materiales en contacto con el líquido
Preparación de amplificaciónVolumen de cada componente, propiedades de la solución enzimática, temperatura, puntas y recipientes de reacción y orden de adición del molde
Recuperación tras anomalíasRealimentación de acciones, registro de pocillos, posibilidad de reintento y reglas de tratamiento de muestras

04Lisis y preparación de reactivos: configurar según las formulaciones reales

Para reactivos con sales, etanol u otros componentes orgánicos, compruebe cámara de bomba, elementos internos de válvula, juntas y tubos con la formulación real. Los resultados de dosificación con agua solo sirven como comprobación preliminar; establezca por separado las condiciones de aspiración, dispensación, permanencia y limpieza de los reactivos reales.

El suministro fijo es adecuado para dispensar repetidamente reactivos comunes. Compartir bombas y válvulas reduce componentes, pero exige tiempo de conmutación, desplazamiento y limpieza. Evalúe canales dedicados si el consumo de limpieza es alto, los residuos son inaceptables o el trabajo paralelo requiere ciclos ajustados. Compare el ahorro de componentes con consumo, duración y mantenimiento.

  • Dispensación de reactivos de lisis y unión mediante circuitos fijos

Lecturas técnicas complementarias

  • ¿Qué es una bomba de jeringa programable? Funcionamiento, rutas y automatización
  • Materiales en contacto con el líquido: cabezal, rotor y sellos de la válvula rotativa

05Separación, lavado y elución: evaluar las acciones mediante la recuperación de ácidos nucleicos

En los procesos con pipeteo, el lavado suele conservar las partículas y retirar el líquido; tras la elución se transfiere el eluido con ácidos nucleicos. Configure por separado posición, velocidad y espera de separación magnética; unos volúmenes parecidos no justifican reutilizar la misma secuencia.

En los procesos con varillas magnéticas, la atención se centra en la recogida y liberación de partículas, el líquido arrastrado entre pocillos y la recuperación del eluido tras retirar las partículas. La necesidad de aspiración depende de los pasos anteriores y posteriores. Esperar más puede mejorar la separación, pero reduce el rendimiento; decida según el estado de las partículas, los residuos y la recuperación, sin prolongar todas las esperas por igual.[1]

Los residuos tras el lavado y la pérdida de ácidos nucleicos son problemas distintos. Al eliminar residuos, compruebe también el efecto del eluido en la reacción posterior. Al aumentar la recuperación, verifique si se arrastran más partículas o componentes no deseados.

  • Lavado con puntas y transferencia del eluido de ácidos nucleicos

Lecturas técnicas complementarias

  • ¿Qué es una bomba de pipeteo automática programable por desplazamiento de aire?
  • ¿Qué es el pipeteo? Procesos manuales y automatizados

06Circuitos y aislamiento: definir los recorridos de ácidos nucleicos, reactivos y residuos

Las válvulas de conmutación pueden servir al suministro fijo de reactivos; las muestras y el eluido no necesitan pasar por la misma válvula. Si se comparten circuitos, explique en cada tramo por qué, adónde van los residuos y cómo se valida la limpieza. Compruebe reflujo, conmutación errónea y contacto cruzado durante mantenimiento entre circuitos de ácidos nucleicos y residuos, tanto en funcionamiento normal como con fallos.

La zonificación debe cubrir preparación de reactivos, tratamiento y extracción de muestras, adición de molde, amplificación y operaciones posteriores. Defina al menos el aislamiento antes y después de amplificar, organizando recorridos mediante espacio, consumibles cerrados y operaciones unidireccionales. Los objetos que contactan con productos amplificados y las tareas de mantenimiento deben evitar devolver contaminación a las zonas previas. Las puntas con filtro son una medida, pero no sustituyen la gestión de circuitos y operaciones.[2]

  • Aislamiento de circuitos de reactivo, eluido de ácidos nucleicos y residuos

Lecturas técnicas complementarias

  • Guía de selección de válvulas rotativas: del circuito a la validación del sistema

07Conexiones: considerar adsorción y recuperación completa

Cuando pequeños volúmenes de eluido pasan por tubos fijos, las cavidades de los racores y la retención pueden representar una parte considerable del volumen recuperable. Acortar el circuito reduce la retención, pero un diámetro demasiado pequeño aumenta la resistencia. Evalúe conexiones y tubos conjuntamente, sin comparar solo la exactitud nominal de la bomba.

La resistencia química y la recuperación de ácidos nucleicos son comprobaciones distintas. Compare la recuperación de la muestra objetivo a través del circuito real con un tratamiento de referencia, incluyendo conexiones, juntas y tiempo de permanencia. Las puntas desechables acortan el circuito reutilizado, pero siguen requiriendo comprobar material, adherencia a paredes, líquido residual y sellado de montaje.

  • Tubos y racores en diagnóstico molecular

Lecturas técnicas complementarias

  • Guía de selección de racores para tubos en microfluídica: reborde, férula y anillo de retención

08Monitorización: relacionar la preparación de amplificación con el estado de la muestra

Defina el orden de reparto de mezcla maestra, adición de molde y mezcla. Para componentes enzimáticos o viscosos, desarrolle las secuencias a temperatura y dosis reales y compruebe espera de aspiración, residuos de dispensación, mezcla y espuma. Los módulos por desplazamiento de aire pueden automatizar el pipeteo, pero sus funciones no demuestran la compatibilidad de todo el método.[3]

La detección de burbujas o presión emite señales de anomalía que el control del equipo asocia con pocillo, líquido y acción actuales. Registre volumen ordenado, realimentación y resultados de detección, distinguiendo transferencia estimada y volumen medido. Si una alarma deja incierto cuánto líquido contiene el pocillo, siga el tratamiento previsto por el método; repetir directamente puede alterar las proporciones.

Si el cambio de puntas, la temperatura o la limpieza ralentizan un cabezal compartido, evalúe canales independientes para mezcla maestra y molde. Aun separados, requieren controlar consumibles, disposición y orden de operación.

  • Detección de burbujas y presión en diagnóstico molecular

Lecturas técnicas complementarias

  • ¿Por qué las burbujas retrasan o alteran la dosificación de una bomba de pistón?

09Explore configuraciones mediante las guías de aplicación de productos

Utilice las siguientes preguntas para elegir el punto de partida de evaluación al preparar los datos de configuración:

  • Bombas de jeringa: ¿qué dosis por operación, ciclos continuos y limpieza entre cambios requiere el suministro fijo de reactivos?
  • Bombas de pipeteo por desplazamiento de aire: SMTP2 integra control de accionamiento y detección de nivel, obstrucción y punta; SMTP4 admite expulsión automática de puntas y requiere accionamiento y detección aportados por el fabricante del equipo. Seleccione según el reparto de integración; la capacidad nominal no sustituye la validación de dosis mínima.

Fuentes:[6]

  • Bombas de diafragma: ¿repondrán una estación de lavado o evacuarán residuos con aire, y necesitan amortiguación y control de nivel independientes?
  • Válvulas rotativas multipuerto: ¿compensa la reducción de canales el coste de limpiar tramos compartidos y validar la contaminación entre líquidos?
  • Detección y conexiones: ¿cómo se asocian las anomalías con los pocillos y cómo se demuestra la idoneidad de materiales y recuperación en todo el circuito?
  • Ver la lista de datos de configuración en la visión general
  • Bombas de jeringa en diagnóstico molecular
  • Bombas de pipeteo por desplazamiento de aire en diagnóstico molecular
  • Bombas de diafragma en diagnóstico molecular
  • Válvulas rotativas multipuerto en diagnóstico molecular
  • Detección de burbujas y presión en diagnóstico molecular
  • Tubos y racores en diagnóstico molecular

10Valide el ciclo completo mediante los resultados de la aplicación

Mida por separado volumen, recuperación, inhibición y contaminación y relaciónelos con un mismo ciclo completo. Un control negativo satisfactorio solo indica que no se detectó la anomalía correspondiente bajo esas condiciones.

Valide el ciclo completo mediante los resultados de la aplicación
Objeto de validaciónResultados observadosAjuste de configuración correspondiente
Dispensación de reactivos realesVolumen real añadido en la primera dosis, las consecutivas y la últimaSecuencia de aspiración y dispensación, purga, posición de toma o intervalo de la bomba
Separación y eluciónPérdida de partículas, líquido arrastrado, recuperación y comportamiento de la reacción posteriorEspera de separación magnética, posición de aspiración o acción de transferencia de partículas
Circuitos de válvulas y conexionesResiduos tras conmutación, reflujo y recuperación a través del circuito completoLongitud del tramo compartido, estrategia de limpieza o canales dedicados
Amplificación y control de contaminaciónUniformidad de preparación, blancos de extracción, controles sin molde y pruebas alternando muestras altas y bajasReglas de consumibles, zonificación, circuitos y secuencia de operación
Inhibición y recuperaciónControl interno o evaluación de inhibición especificados por el método; trazabilidad de muestras tras alarmasTratamiento posterior al lavado, estado de acción y estrategia de recuperación

Un control negativo por sí solo no demuestra aislamiento completo de contaminación ni ausencia de inhibición. El método concreto debe definir controles, muestras de desafío y criterios de aceptación.

  • Ver métodos generales de validación del equipo

11Preguntas habituales de selección y recuperación

¿Pueden lavado y elución utilizar los mismos ajustes?

Determine primero si se aspira líquido o se transfieren partículas, y después si deben conservarse partículas o eluido. En pipeteo, configure por separado posiciones y velocidades; con varillas, evalúe recogida, liberación y líquido arrastrado. Relacione las acciones con los resultados de recuperación y residuos.

¿Un volumen de transferencia correcto demuestra extracción y control de contaminación correctos?

La aceptación del volumen solo cubre dosificación. Compruebe también recuperación, inhibición, blancos de extracción, controles sin molde y pruebas de contaminación cruzada, incluyendo funcionamiento, recuperación tras parada y mantenimiento.

¿Puede una válvula seleccionar reactivos, eluido y residuos?

No es una configuración predeterminada. Evalúe primero separar suministro fijo de reactivos y transferencia de muestras. Si es necesario compartir, demuestre que residuos, reflujo, limpieza y estados de fallo cumplen el método.

Referencias

Ver referencias (6)
  1. [1]Thermo Fisher · KingFisher magnetic-bead handling principle
  2. [2]Thermo Fisher · qPCR contamination control and work-area zoning
  3. [3]Tecan · Cavro air-displacement pipetting modules
  4. [4]FOREACH | HMD solenoid-valve syringe pump series
  5. [5]FOREACH | HLD rotary-valve syringe pump series
  6. [6]FOREACH | Air-displacement pipetting pumps

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